Critères de classification dans le règne végétal:
1. Selon les méthodes de reproduction
 
 

2.Existence ou non d'organes
 
 

3. Exitence ou non de vaisseaux conduisant la sève
 
 

4.Classification des algues selon les pigments: - Végétaux chlorophylliens

- Phanérogames :végétaux supérieurs: organes de reproduction visibles (fleurs)

- Cryptogames: organes de reproduction non visibles: les algues sont des végétaux inférieurs 

- Cormophytes: organes distincts (tiges, feuilles, racines)

- Thallophytes: organisation cellulaire continue: les algues possèdent des crampons et non des racines; pas de tiges ni de feuilles mais une lame ou un cylindre

- Végétaux vasculaires

- Végétaux non vasculaires: les algues ne possèdent pas de vaisseaux pour conduire la sève
- Photoautotrophes
: se nourrissent d'energie lumineuse: possèdent des pigments capteurs d'energie lumineuse.

Les pigments sont à la base de la classification des algues.
Ils captent l'energie lumineuse et les transfèrent sur la chlorophylle A. La différence de pigmentation s'explique par la différence de pénétration de la lumière dans l'eau de mer en s'enfonçant .
- Chlorophylle A seule

Algues vertes: Chlorophyceae  

phycoérythrines : rouges

phycocyanines : bleus )

Algues rouges: Rhodophyceae

- Chlorophylle A + biliprotéines

Algues bleues: Cyanophyceae

- Chlorophylle A + xanthophylle (jaunes) (fucoxanthine)

Algues brunes: Phaeophyceae

- Algues d'eau douce ou Algues marines

- Thalle unicellulaire (microphyte) ou Thalle pluricellulaire (macrophyte) 

5. Selon l'habitat

6. Selon l'organisation du thalle

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